疫苗的配制分装。纯化后疫苗可按要求进行配制灌装，如果做成小针剂，一般为西林瓶形式，安瓿由于掉玻璃屑等原因已经濒临淘汰风淋门，作为生物制品，高温封口也会造成不稳定因素。由于疫苗的稳定性比较差，为了长期保存而不降低效力，很多厂家都将疫苗制成冻干针。
防止交叉污染，严格分区，独立空调，局部负压。从疫苗生产全过程来看，可以分为，有毒区（灭活前）、无毒区（灭活后至配制前）、制剂区。一般应该配制独立的空调系统，
在实验室中疫苗的浓缩纯化。灭活后的疫苗可以进行浓缩（也可不浓缩），然后为了消除接种后的不良反应，需要纯化去除动物组织及培养基中的牛血清等。一般细胞培养的疫苗只需要通过树脂柱分离纯化即可，需要注意的是，如果分离时间较长，需要在-4℃的冷柜保护下分离纯化。疫苗生产的所有中间需要贮藏的环节都需要设置-4℃的冷库。
尽可能一个产品一个车间。如共用生产车间交替生产不同品种，必须进行有效清洁、消毒和验证后，后一种制品生产用的菌种或毒种或生产用细胞才能进入车间。强毒细菌及病毒株与弱毒细菌及病毒株，决不允许混放在一起，亦不允许同时在同一实验室内进行检定实验，更不允许在同一生产车间内进行强毒和弱毒的疫苗生产制备。各种灭活疫苗灭活后可与其他无菌生物制品交替使用同一灌装间和灌装、冻干设施。但在一种制品分装后圣洁风淋室，必须进行有效的清洁和消毒，清洁消毒效果应定期验证。
保护环境和操作者。尤其对于一些强毒的操作，一定要有安全措施，另外要防止毒的泄漏。污染物要有专门的通道，灭菌后排放。来自生物危险度二类以上的病原体的空气应通过高效过滤器排放，滤器的性能应定期检查。
实验室中生物制品设计要点
由上面我们可以看出，作为设计者在进行生物制品的设计时，需要注意以下几点：
对于实验室等小规模生产的情况，也可以考虑无毒区和制剂区不完全分开。有毒区和无毒区污水排放要相互独立。在考虑压差时，首先满足无毒区压差高于有毒区，然后再考虑高洁净级别压差要高于低洁净级别的原则。
严格动物使用及动物管理。动物房应为独立封闭的建筑物，具有独立的空气净化系统。应为进入动物房工作的员工提供特殊的工作服，具有更衣和淋浴设施风淋门。用于制备注射用活疫苗的动物细胞必须来自清洁级或清洁级以上动物；用于制备口服疫苗和灭活疫苗的动物细胞应来自封闭式房舍内饲养的健康动物；生物制品质量检定用动物，除有特殊规定外，应是清、级或清洁级以上动物。了解相关法规及要求。
